W dniu 6 listopada 2018 r. Zarząd Krajowej Rady Izb Rolniczych wystąpił do Ministra Rolnictwa i Rozwoju Wsi o umożliwienie weryfikacji błędów we wnioskach o płatności rolnośrodowiskowe przez wprowadzanie poprawek we wnioskach złożonych przez aplikację eWniosekPlus.
Brak możliwości skorygowania błędów zaistniałych przy wprowadzaniu danych gdy działanie aplikacji nie było w pełni wdrożone, będzie skutkowało nałożeniem na rolników kar nawet kilka lat wstecz, pomimo że działanie rolnośrodowiskowe jest realizowane prawidłowo.
Samorząd rolniczy wnioskował o wprowadzenie możliwości wprowadzania zmian przez doradców rolno-środowiskowych i uruchomienie przez Agencję Restrukturyzacji i Modernizacji Rolnictwa takiej funkcjonalności do eWniosekPlus.